藏醫(yī)藥古籍是藏醫(yī)藥學(xué)知識的主要載體，發(fā)掘、整理藏醫(yī)藥古籍是傳承藏醫(yī)藥知識的重要途徑，具有重要的科學(xué)技術(shù)、學(xué)術(shù)和經(jīng)濟(jì)價值。由于歷史和社會的各種原因，目前藏醫(yī)藥古籍的數(shù)量還不清楚。在黨的民族政策和衛(wèi)生工作方針指引下，藏醫(yī)藥古籍整理得到了高度重視，取得了一些階段性的成果。

青海省藏醫(yī)藥研究院近十年來一直致力于藏醫(yī)古籍的收集和整理工作。由其組織、編輯、整理的《藏醫(yī)藥經(jīng)典文獻(xiàn)集成》自2004年起由民族出版社分批出版發(fā)行，目前已經(jīng)出版了500多部。其中2009年度出版了《寶藏醫(yī)學(xué)選編》《藏醫(yī)療病儀軌》《宇妥醫(yī)卷·四部醫(yī)典研究》《仲曼心精·所想皆俱》《藏中醫(yī)術(shù)精選·入迷珊瑚串》《德格拉曼醫(yī)著》《后續(xù)部注釋匯集》7部古籍?！秾毑蒯t(yī)學(xué)選編》收集了30余篇掘藏的藏醫(yī)藥學(xué)著作，內(nèi)容主要為診斷和醫(yī)治疾病的秘訣秘法。《藏醫(yī)療病儀軌》由《防病療病儀軌匯集》和《療病誦咒儀軌手冊》兩部著作合成，內(nèi)容為治療和預(yù)防特殊疾病、保健和養(yǎng)生等方面的傳統(tǒng)藏醫(yī)特有儀軌?！队钔揍t(yī)卷·四部醫(yī)典研究》由《宇妥醫(yī)卷》和《四部醫(yī)典研究》兩部著作合成。其中《宇妥醫(yī)卷》概述了藏醫(yī)各疾病類型和種類的診斷原理和方法，《四部醫(yī)典》研究從佛教哲學(xué)的角度對藏醫(yī)經(jīng)典《四部醫(yī)典》做了評述。《仲曼心精·所想皆俱》收集了藏醫(yī)學(xué)家仁青旺杰的藏醫(yī)藥學(xué)著作17余部（篇）和藏醫(yī)學(xué)家公卻盤德的《所想皆懼》。前者匯集了作者對各種疾病雜癥的治療方法，后者則是一部藏醫(yī)學(xué)概論性著作?！恫刂嗅t(yī)術(shù)精選·入迷珊瑚串》由《藏中醫(yī)術(shù)精選·入迷》和《珊瑚串》兩部著作合成。內(nèi)容為治療疑難病的秘訣和部分藏藥的配制和功效?！兜赂窭t(yī)著》收集了德格拉曼的藏醫(yī)藥學(xué)著作4部，內(nèi)容涉及藏醫(yī)學(xué)原理，病癥的診斷和疾病的治療，以及實踐經(jīng)驗和秘訣等，是一部綜合性的藏醫(yī)著作集?！逗罄m(xù)部注釋匯集》收集了10部《四部醫(yī)典》中的后續(xù)部的注釋，內(nèi)容有脈診原理及其方法，湯、散、丸、膏等劑型的配制和使用方法，火灸、放血療法等外治法。

另外，還有青海民族出版社出版的系列“珍貴藏醫(yī)藥文集”（5部）和四川民族出版社出版的金巴才旺所著《四部醫(yī)典后續(xù)部詳解》，其內(nèi)容基本上與民族出版社出版的《藏醫(yī)藥經(jīng)典文獻(xiàn)集成》著作重復(fù)，此不贅。

李多美的《簡明藏醫(yī)辭典》（民族出版社）則是我國首部藏漢文雙解藏醫(yī)專業(yè)工具書。全書共7000余條，收集、整理了藏醫(yī)典籍中有關(guān)生理、病因、診斷、治療、藥物、配方及名醫(yī)簡歷、文獻(xiàn)名稱等方面的名詞術(shù)語的原文注釋，并加以翻譯。本辭典通過對藏醫(yī)藥文獻(xiàn)資料，以及諸多注釋論著進(jìn)行初步的綜合整理，為廣大藏醫(yī)藥研究、學(xué)習(xí)者提供了較為全面、系統(tǒng)的專業(yè)工具書。